Bioestadística aplicada: Diseño experimental de datos enfocados en biología molecular y celular mediante Sigmaplot y SPS

Descripción del curso

Este curso abordará de manera teorico práctica el análisis estadístico de datos involucrados en la investigación cientifica, asistido por software SPSS 25, SigmaPlot14, Minitab y Real Statistics. El curso abordará los principios y fundamentos de las técnicas estadísticas aplicadas a datos relacionados en laboratorios de biología molecular, celular y la industria enfocada en biotecnológica. 

Se realizaran ejercicios prácticos enfocados en biologia molecular y celular para cada analisis estaditico dispuesto en el temario del curso, abordando ejercicios como ANOVA unifactorial y pruebas post-hoc (Reducción de la viabilidad celular de fármaco con posible efecto antitumoral en células MDA-MB-231). ANOVA unifactorial de medidas repetidas (Selección de un medio de cultivo óptimo para la producción de anticuerpos monoclonales), entre otros.

TEMARIO

Modulo I: Introducción

1.1. Introducción a la estadística inferencial

1.2. Distribuciones de probabilidad.

1.3.Pruebas de normalidad y homocedasticidad .

1.4. Inferencia estadística por pruebas de hipótesis paramétricas y no paramétricas.

1.5. Análisis de datos categóricos independiente: chi cuadrada, z de proporciones, razón de momios y prueba exacta de Fisher .

1.6. Análisis de datos categóricos independiente: prueba exacta de Fisher.

1.7. Análisis de datos categóricos pareados: Prueba de McNemar .

1.8. Análisis de datos categóricos pareados: Q de Cochran .

Modulo I: Ejercicios prácticos

1. Uso de SPSS y Minitab: ¿Cuál es la distribución de probabilidad de las colonias transformadas por un plásmido X?

2. Uso de SigmaPlot y SPSS: ¿Los porcentajes de viabilidad celular siguen una distribución normal?

3. Uso de SigmaPlot, SPSS y Real Statistics: Genotipo y fenotipo con cuadros de Punnett.

4. Uso de SigmaPlot y SPSS: ¿Existe diferencia en el ciclo celular entre células “wildtype” y mutantes?

5. Uso de SigmaPlot y SPSS: Identificar presencia de virus de influenza con prueba inmunocromatográfica de diagnóstico rápido por fluorescencia.

6. Uso de SigmaPlot y SPSS: Estudios de asociación genética de enfermedades heterogéneas).

Modulo II: Contraste de hipótesis de comparación de dos grupos, análisis de regresión lineal y tipos de correlación

2.1 Comparación de dos grupos con datos cuantitativos independientes

2.1.1 Prueba t de student de muestras independientes

2.1.2 Prueba de U de Mann-Whitney

2.2 Comparación de dos grupos con datos cuantitativos para muestras pareadas

2.2.1 Prueba t de student pareada

2.1.2 Prueba de t de Wilcoxon

2.3 Análisis de regresión y correlación

2.3.1 Regresión lineal simple

2.3.2 Correlación de Pearson

2.3.3 Correlación de Spearman

Modulo II: Ejercicios prácticos

1. Uso de SigmaPlot y SPSS: Aplicaciones en los microarreglos.

2. Uso de SigmaPlot y SPSS: Análisis alternativo de datos de RT-qPCR

3. Uso de SigmaPlot, SPSS Verificando la reproducibilidad de experimentos de cultivo celular utilizando el diámetro celular de células congeladas vs células frescas.

4. Uso de SigmaPlot, SPSS: Análisis de viabilidad celular previo y posterior a un tratamiento

5. Uso de SigmaPlot y SPSS: Cálculo de concentración mínima inhibitoria.

6. Uso de SigmaPlot y SPSS: Correlación entre la distancia entre células y el tamaño de células en la organización del citoesqueleto de embriones y larvas de Drosophila.

7. Tiempo de exposición a un fármaco y forma morfología celular

Modulo III: Diseños experimentales para comparación de más de dos grupos.

3.1 Diseños experimentales

3.1.1 Diseños experimentales de un solo factor: completamente al azar, bloques completos al azar y cuadrados latinos.

3.1.2 Diseños experimentales factoriales: factoriales 2k-3k, parcelas dividas, bloques divididos.

3.2 Contraste de hipótesis de comparación de más de dos grupos.

3.2.1 Pruebas de análisis de varianza (ANOVA) y tipos

3.2.2 ANOVA unifactorial y pruebas post-hoc

3.2.3 Prueba H de Kruskal-Wallis

3.2.4 ANOVA unifactorial de medidas repetidas

3.2.5 Prueba de Friedman

3.2.6 ANOVA factorial

Modulo III: Ejercicios prácticos

1. Uso de SigmaPlot y SPSS: Reducción de la viabilidad celular de fármaco con posible efecto antitumoral en células MDA-MB-231

2. Uso de SigmaPlot y SPSS: Comparación del daño de la membrana celular causado por diferentes agentes para despegar células adherentes

3. Uso de SigmaPlot, SPSS: Selección de un medio de cultivo óptimo para la producción de anticuerpos monoclonales

4. Uso de SigmaPlot, SPSS: ¿La reducción en la viabilidad celular es debido a la apoptosis? Ensayo TUNEL basado en citometría de flujo

5. Uso de SigmaPlot y SPSS: Efecto de fármaco con posible actividad antitumoral a diferentes concentraciones y diferentes tiempos de exposición en las líneas celulares MDA-MB-231 y MCF-7

REQUISITOS: Conocimiento de matemáticas nivel de pregrado, Excel nivel intermedio.