Bioinformatica aplicada

Descripción del curso

Este curso contemplará de manera 100% práctica información necesaria para aprender a hacer uso de forma correcta de dos softwares científicos (SnapGene y Benchling). Adquirirá conocimientos que le permitan desarrollar soluciones in silico de problemas biológicos y biotecnológicos que surgen en la investigación al formular hipótesis nuevas. Se realizaran ejercicios prácticos biotecnológicos para cada herramienta dispuesta en Snapgene y Benchling, abordando temas como diseño de primers para amplificar el antígeno carcinoembrionario, métodos de clonación, diseño y alineación de secuencias, plásmidos recombinantes, protocolo para cultivo celular, oligonucleótidos empleados en biomedicina, diseño de RNA guía enfocado en edición genomica CRISPR.

TEMARIO DEL CURSO:

Modulo I: Generalidades de SnapGene

· Instalación

· Opciones de visualización para secuencias de ADN

· Opciones de visualización para secuencias de proteínas

· Otras opciones de visualización

· Panel de descripción

· Enzimas

· Características de SnapGene

Modulo II: Funciones de SnapGene

· Funciones personalizadas

· Primers

· Traducciones

· RNA

· Proteinas

· Diferentes tipos de Clonación

· PCR y mutagénesis

· Simulación de geles de agarosa

· Editar secuencias

· Alineación múltiple y por pares

· Diseñar secuencias

· Uso de codones

Modulo III: Ejemplos prácticos biotecnológicos para cada herramienta dispuesta de SnapGene

· Diseño de Primers para amplificar el antígeno carcinoembrionario (CEA)

· Diseño de un plásmido recombinante por varios métodos de clonación

· Verificación de alineación de secuencias

· Diseño de Secuencias especificas

Modulo IV: Generalidades de Benchling

· Herramientas de benchling

· Entradas y Protocolos

· secuencias de ADN

· AA secuencias

· Oligonucleótidos

· CRISPR

Modulo V: Ejemplos prácticos para cada herramienta dispuesta de benchling

· Diseño de un plásmido recombinante con interés biotecnológico

· Diseño de un protocolo para cultivo celular

· Diseño de oligonucleótidos con empleo en biomedicina

· Diseño de un RNA guía para emplearlo en edición genómica dirigida CRISPR

El programa está dirigido a estudiantes universitarios, egresados y profesionales, de las áreas de Biotecnología, medicina, biología, biomedicina, bioingeniería y afines interesados en aprender herramientas bioinformáticas básicas para ser utilizadas en el trabajo día a día en el laboratorio como herramientas de apoyo.